近日,药物化学领域权威期刊Journal of Medicinal Chemistry(IF=6.8)在线发表了我校制药工程学院陈国良教授课题组在sEH抑制剂研究领域取得的最新研究成果,论文题目为“Design and synthesis of sEH/HDAC6 dual-targeting inhibitors for treatment of inflammatory pain”。
炎症包括多种生理和病理过程,涉及不同的细胞类型和细胞反应。可溶性环氧化物水解酶(sEH)催化环氧二十碳三烯酸(EETs)转化为相应的二醇或二羟基二十碳三烯酸(DHET)。大量研究表明,sEH抑制剂能够抑制IκB激酶活性,阻断NF-κB信号通路,可以显著减轻炎症和疼痛。HDAC6抑制剂可以通过抑制IκB磷酸化来阻断NF-κB的激活,从而抑制炎症信号通路,这表明sEH与HDAC6共同影响NF-κB信号通路,进而调节下游促炎细胞因子(IL-6,IL-1β,TNF-α,IL-17)的转录。因此,课题组提出设计sEH/HDAC6双靶点抑制剂,以增强化合物对NF-κB信号通路的调控作用,用于治疗与炎症相关疾病与症状。
Role of sEH and HDAC6 inhibitors in inflammation
以课题组前期发现的sEH抑制剂GL-B437与选择性HDAC6抑制剂Ricoliostat为先导化合物,运用拼合原理和生物电子等排原理,结合计算机辅助药物设计,得到了一系列sEH/HDAC6双靶点抑制剂。分子对接显示化合物28g与sEH蛋白和HDAC6蛋白能很好地结合,而与HDAC1、HDAC2和HDAC3的结合很弱且与关键氨基酸没有作用:
(A, B) Predicted complex of 28g (pink) and GL-B437(yellow) and TUCB (green) to sEH (PDB ID: 3WKE). (C, D) Predicted complex of 28g (pink) and Rocilinostat (yellow) to HDAC6 (PDB ID: 5WGL).
(A) Predicted complex of 28g (pink) to HDAC1. human HDAC2 (PDB ID: 4LXZ) was selected to model the 3D structure of HDAC1. (B) 2D diagram of predicted complex of 28g (pink) to HDAC1. (C) Predicted complex of 28g (pink) to HDAC3 (PDB ID: 4A69). (D) 2D diagram of predicted complex of 28g to HDAC3.
酶抑制活性实验结果显示28g对sEH和HDAC6均表现出较好的抑制效果,IC50值分别为0.9nM、8.0nM,28g对HDAC1,HDAC2,HDAC3,HDAC8,HDAC11的IC50分别为1151nM,492 nM,1276nM,62nM和464nM,显示出很好的HDAC6选择性。同时28g表现出良好的肝微粒体稳定性、中等的血浆蛋白结合率,和较好的口服生物利用度。在小鼠疼痛模型和小鼠耳肿胀模型中,化合物28g的镇痛活性比单独使用sEH抑制剂(GL-B437)或HDAC6抑制剂(Rocilinostat)以及两种抑制剂合用时的效果更佳,二甲苯诱发的小鼠耳肿胀模型中,化合物28g对耳肿胀抑制作用也明显强于选择性COX-2抑制剂塞来昔布,28g明显降低LPS诱导的RAW264.7细胞IL-6,IL-1β,TNF-α和NO的释放。因此,这些新型sEH/HDAC6双靶向抑制剂在伤害性行为中表现出强大的镇痛活性,值得进一步开发。
我校2023级博士研究生徐华伸和2020级博士研究生陈远广(现在南方科技大学从事博士后工作)为论文共同第一作者,制药工程学院陈国良教授、加利福尼亚大学戴维斯分校Bruce D. Hammock院士和药学院刘中博副教授为共同通讯作者,无涯创新学院景永奎教授课题组对该研究做出了重要贡献。该研究得到了国家自然科学基金面上项目(82273793)和辽宁省教育厅重点攻关项目(JYTZD2023134)以及美国国家环境卫生科学研究所超级项目(P42 ES004699)的支持。
文章链接:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c00847